Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apoa4P06728 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoa4P06728 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms