Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06328 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06328 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06328 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06328 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06328 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06328 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06328 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06328 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06328 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06328 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06328 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06328 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06328 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06328 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06328 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06328 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06328 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06328 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06328 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06328 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06328 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06328 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06328 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06328 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06328 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06328 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06328 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06328 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06328 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06328 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06328 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06328 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06328 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms