Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P04214 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P04214 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P04214 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P04214 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P04214 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04214 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04214 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04214 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04214 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04214 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04214 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04214 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04214 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04214 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04214 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04214 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04214 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P04214 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04214 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04214 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04214 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04214 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P04214 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P04214 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04214 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P04214 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04214 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04214 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04214 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04214 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04214 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04214 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04214 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04214 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04214 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04214 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04214 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04214 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04214 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P04214 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04214 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04214 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04214 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04214 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04214 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04214 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04214 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04214 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04214 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04214 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04214 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04214 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms