Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk1P04184 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tk1P04184 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tk1P04184 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tk1P04184 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tk1P04184 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tk1P04184 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tk1P04184 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tk1P04184 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms