Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa7P02830 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa7P02830 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa7P02830 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa7P02830 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms