Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc1P02468 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc1P02468 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc1P02468 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc1P02468 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lamc1P02468 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.3 ms