Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01787 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01787 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01787 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01787 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01787 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01787 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01787 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01787 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01787 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01787 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01787 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01787 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01787 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01787 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01787 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01787 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01787 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01787 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01787 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01787 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01787 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01787 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01787 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01787 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01787 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01787 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01787 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01787 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01787 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01787 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01787 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01787 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01787 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01787 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01787 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01787 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01787 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01787 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01787 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01787 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01787 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01787 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01787 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01787 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01787 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms