Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01748 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01748 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01748 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01748 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01748 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01748 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01748 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01748 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01748 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01748 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01748 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01748 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01748 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01748 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01748 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01748 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01748 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01748 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01748 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01748 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01748 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01748 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01748 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01748 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01748 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01748 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01748 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01748 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01748 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms