Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01652 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01652 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01652 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01652 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01652 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01652 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01652 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01652 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01652 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01652 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01652 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01652 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01652 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01652 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01652 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01652 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01652 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01652 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01652 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01652 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01652 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01652 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01652 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01652 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01652 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01652 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01652 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01652 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01652 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01652 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01652 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01652 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01652 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01652 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01652 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01652 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01652 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01652 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01652 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01652 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01652 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01652 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01652 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01652 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01652 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01652 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01652 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01652 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01652 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01652 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01652 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01652 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01652 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01652 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 789 ms