Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1aO89116 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1aO89116 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vti1aO89116 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1aO89116 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms