Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp8O89110 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp8O89110 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp8O89110 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp8O89110 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms