Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdc6O89033 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdc6O89033 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc6O89033 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc6O89033 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms