Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apaf1O88879 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Apaf1O88879 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apaf1O88879 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apaf1O88879 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apaf1O88879 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms