Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZfrO88532 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZfrO88532 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZfrO88532 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZfrO88532 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZfrO88532 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZfrO88532 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZfrO88532 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfrO88532 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZfrO88532 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZfrO88532 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms