Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnal1O88327 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnal1O88327 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnal1O88327 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnal1O88327 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1035.2 ms