Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppargc1aO70343 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1aO70343 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppargc1aO70343 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms