Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf5O70191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf5O70191 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf5O70191 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf5O70191 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf5O70191 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atf5O70191 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf5O70191 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf5O70191 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf5O70191 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf5O70191 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf5O70191 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms