Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HcrtO55241 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HcrtO55241 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HcrtO55241 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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HcrtO55241 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HcrtO55241 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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HcrtO55241 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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HcrtO55241 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HcrtO55241 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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HcrtO55241 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HcrtO55241 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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HcrtO55241 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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HcrtO55241 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HcrtO55241 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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HcrtO55241 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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