Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb2O55203 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb2O55203 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms