Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap2O55126 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nipsnap2O55126 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap2O55126 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms