Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap1O55125 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap1O55125 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap1O55125 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms