Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
StrnO55106 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StrnO55106 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StrnO55106 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
StrnO55106 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StrnO55106 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
StrnO55106 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
StrnO55106 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
StrnO55106 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
StrnO55106 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
StrnO55106 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
StrnO55106 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
StrnO55106 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
StrnO55106 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
StrnO55106 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
StrnO55106 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
StrnO55106 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
StrnO55106 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
StrnO55106 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
StrnO55106 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
StrnO55106 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
StrnO55106 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
StrnO55106 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
StrnO55106 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
StrnO55106 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
StrnO55106 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StrnO55106 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
StrnO55106 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
StrnO55106 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
StrnO55106 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
StrnO55106 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
StrnO55106 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
StrnO55106 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StrnO55106 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StrnO55106 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StrnO55106 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
StrnO55106 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
StrnO55106 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
StrnO55106 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
StrnO55106 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
StrnO55106 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
StrnO55106 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
StrnO55106 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
StrnO55106 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
StrnO55106 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
StrnO55106 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
StrnO55106 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StrnO55106 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StrnO55106 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
StrnO55106 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
StrnO55106 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
StrnO55106 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
StrnO55106 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
StrnO55106 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
StrnO55106 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
StrnO55106 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
StrnO55106 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
StrnO55106 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
StrnO55106 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
StrnO55106 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StrnO55106 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StrnO55106 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms