Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnk2O54967 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnk2O54967 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms