Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajb6O54946 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajb6O54946 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajb6O54946 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms