Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf12O54907 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf12O54907 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms