Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EomesO54839 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EomesO54839 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EomesO54839 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EomesO54839 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EomesO54839 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EomesO54839 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EomesO54839 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EomesO54839 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EomesO54839 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EomesO54839 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EomesO54839 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EomesO54839 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EomesO54839 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EomesO54839 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EomesO54839 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EomesO54839 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EomesO54839 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EomesO54839 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EomesO54839 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EomesO54839 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EomesO54839 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EomesO54839 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EomesO54839 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EomesO54839 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EomesO54839 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EomesO54839 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EomesO54839 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EomesO54839 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EomesO54839 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EomesO54839 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EomesO54839 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EomesO54839 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EomesO54839 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EomesO54839 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EomesO54839 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EomesO54839 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EomesO54839 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EomesO54839 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EomesO54839 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EomesO54839 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EomesO54839 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EomesO54839 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EomesO54839 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EomesO54839 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EomesO54839 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EomesO54839 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EomesO54839 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EomesO54839 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EomesO54839 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EomesO54839 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EomesO54839 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EomesO54839 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EomesO54839 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EomesO54839 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EomesO54839 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EomesO54839 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EomesO54839 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms