Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NmbrO54799 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NmbrO54799 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NmbrO54799 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbrO54799 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NmbrO54799 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NmbrO54799 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms