Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DffaO54786 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DffaO54786 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DffaO54786 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DffaO54786 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DffaO54786 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DffaO54786 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DffaO54786 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DffaO54786 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DffaO54786 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DffaO54786 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DffaO54786 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DffaO54786 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DffaO54786 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DffaO54786 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DffaO54786 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DffaO54786 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DffaO54786 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DffaO54786 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DffaO54786 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DffaO54786 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DffaO54786 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DffaO54786 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DffaO54786 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DffaO54786 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DffaO54786 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DffaO54786 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DffaO54786 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DffaO54786 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DffaO54786 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DffaO54786 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DffaO54786 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms