Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per1O35973 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per1O35973 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Per1O35973 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per1O35973 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per1O35973 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per1O35973 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Per1O35973 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per1O35973 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per1O35973 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per1O35973 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per1O35973 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Per1O35973 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Per1O35973 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per1O35973 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per1O35973 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per1O35973 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per1O35973 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Per1O35973 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per1O35973 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per1O35973 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per1O35973 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Per1O35973 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Per1O35973 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per1O35973 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Per1O35973 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per1O35973 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Per1O35973 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Per1O35973 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Per1O35973 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Per1O35973 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Per1O35973 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Per1O35973 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Per1O35973 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Per1O35973 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Per1O35973 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Per1O35973 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Per1O35973 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Per1O35973 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Per1O35973 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Per1O35973 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per1O35973 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per1O35973 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per1O35973 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Per1O35973 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Per1O35973 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Per1O35973 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Per1O35973 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Per1O35973 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per1O35973 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per1O35973 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per1O35973 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per1O35973 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Per1O35973 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Per1O35973 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Per1O35973 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per1O35973 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per1O35973 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per1O35973 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per1O35973 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Per1O35973 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms