Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33bO35963 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab33bO35963 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab33bO35963 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33bO35963 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.4 ms