Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnd2O35927 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd2O35927 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd2O35927 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms