Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk5r2O35926 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms