Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chil3O35744 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chil3O35744 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chil3O35744 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chil3O35744 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chil3O35744 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chil3O35744 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms