Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf12O35738 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf12O35738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms