Protein–RNA interactions for Protein: O35718

Socs3, Suppressor of cytokine signaling 3, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs3O35718 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Socs3O35718 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Socs3O35718 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Socs3O35718 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Socs3O35718 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms