Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag2O35638 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag2O35638 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag2O35638 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag2O35638 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag2O35638 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag2O35638 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag2O35638 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag2O35638 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag2O35638 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stag2O35638 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stag2O35638 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stag2O35638 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stag2O35638 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stag2O35638 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stag2O35638 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms