Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1aO35526 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx1aO35526 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx1aO35526 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms