Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppef2O35385 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppef2O35385 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppef2O35385 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppef2O35385 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppef2O35385 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms