Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArxO35085 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArxO35085 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArxO35085 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArxO35085 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArxO35085 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArxO35085 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArxO35085 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArxO35085 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ArxO35085 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArxO35085 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArxO35085 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ArxO35085 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArxO35085 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ArxO35085 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ArxO35085 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ArxO35085 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ArxO35085 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ArxO35085 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ArxO35085 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ArxO35085 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ArxO35085 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArxO35085 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArxO35085 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ArxO35085 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ArxO35085 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArxO35085 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArxO35085 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ArxO35085 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ArxO35085 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ArxO35085 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ArxO35085 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArxO35085 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ArxO35085 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArxO35085 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArxO35085 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArxO35085 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArxO35085 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ArxO35085 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ArxO35085 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ArxO35085 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ArxO35085 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ArxO35085 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ArxO35085 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ArxO35085 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ArxO35085 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ArxO35085 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ArxO35085 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ArxO35085 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ArxO35085 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ArxO35085 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArxO35085 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArxO35085 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ArxO35085 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArxO35085 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ArxO35085 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArxO35085 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArxO35085 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArxO35085 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArxO35085 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms