Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl1O09117 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl1O09117 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl1O09117 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl1O09117 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms