Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ebf3O08791 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ebf3O08791 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms