Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn5O08688 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn5O08688 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn5O08688 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn5O08688 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn5O08688 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn5O08688 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn5O08688 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn5O08688 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn5O08688 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn5O08688 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms