Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MttpO08601 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MttpO08601 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MttpO08601 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MttpO08601 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MttpO08601 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MttpO08601 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MttpO08601 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MttpO08601 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MttpO08601 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MttpO08601 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MttpO08601 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MttpO08601 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MttpO08601 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MttpO08601 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MttpO08601 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MttpO08601 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MttpO08601 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MttpO08601 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MttpO08601 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MttpO08601 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MttpO08601 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MttpO08601 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MttpO08601 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MttpO08601 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MttpO08601 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MttpO08601 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MttpO08601 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MttpO08601 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MttpO08601 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MttpO08601 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MttpO08601 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MttpO08601 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MttpO08601 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MttpO08601 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MttpO08601 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MttpO08601 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MttpO08601 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MttpO08601 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MttpO08601 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MttpO08601 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MttpO08601 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MttpO08601 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MttpO08601 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MttpO08601 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MttpO08601 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MttpO08601 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MttpO08601 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MttpO08601 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms