Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna3O08545 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna3O08545 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna3O08545 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna3O08545 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efna3O08545 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms