Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsmbO08540 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsmbO08540 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsmbO08540 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms