Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d1O08532 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d1O08532 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d1O08532 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna2d1O08532 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d1O08532 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d1O08532 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms