Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20939L7N243 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20939L7N243 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20939L7N243 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms