Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2056J3QQ02 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm2056J3QQ02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms