Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21874J3QNZ6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21874J3QNZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21874J3QNZ6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms