Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9242J3QNY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9242J3QNY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms